More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3086 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  91.72 
 
 
435 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  91.5 
 
 
435 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  91.5 
 
 
435 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  91.5 
 
 
472 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  91.5 
 
 
435 aa  724    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 
434 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  91.44 
 
 
470 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  91.5 
 
 
435 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  78.78 
 
 
430 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  94.91 
 
 
432 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  91.5 
 
 
435 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  91.71 
 
 
434 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  94.91 
 
 
432 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  91.5 
 
 
435 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  94.91 
 
 
432 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  67.2 
 
 
442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  70.59 
 
 
435 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  68.56 
 
 
442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  70.59 
 
 
435 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  71.81 
 
 
458 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  68.51 
 
 
442 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  68.51 
 
 
442 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  68.05 
 
 
442 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  66.67 
 
 
435 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  63.51 
 
 
438 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  66.91 
 
 
439 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  67.39 
 
 
427 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  68.45 
 
 
439 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  70.34 
 
 
435 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  70.34 
 
 
435 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  65.86 
 
 
426 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  70.34 
 
 
435 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  57.83 
 
 
437 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  58.43 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  59.56 
 
 
433 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  58.75 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  56.81 
 
 
436 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  60.2 
 
 
435 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  58.61 
 
 
466 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  60.34 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  60.1 
 
 
429 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  60.59 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  56.97 
 
 
428 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  58.99 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  60.05 
 
 
435 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  57.63 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  57.01 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  57.43 
 
 
412 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  53.39 
 
 
453 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  57.87 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  57 
 
 
409 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  55.74 
 
 
422 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  57.39 
 
 
419 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  53.04 
 
 
441 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  52.98 
 
 
446 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  51.42 
 
 
426 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  51.42 
 
 
426 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  51.68 
 
 
442 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  51.99 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  50.6 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  53.08 
 
 
405 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  56.83 
 
 
417 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  51.84 
 
 
424 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  51.6 
 
 
424 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  48.69 
 
 
415 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  45.43 
 
 
433 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  43.5 
 
 
424 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  40.24 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  40.48 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  40 
 
 
423 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  40 
 
 
423 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  40 
 
 
423 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  40 
 
 
423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  40 
 
 
423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  39.76 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  39.76 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  41.05 
 
 
438 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  41.49 
 
 
466 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
438 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 
422 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  40.57 
 
 
438 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
443 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  39.47 
 
 
438 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  39.47 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  39.47 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  40.48 
 
 
438 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.76 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.76 
 
 
423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  38.97 
 
 
443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.76 
 
 
423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  40.58 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  38.64 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.76 
 
 
423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  39.57 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  38.67 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  38.9 
 
 
424 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  39.1 
 
 
443 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  38.67 
 
 
424 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
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NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  39.34 
 
 
444 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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