More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0826 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  100 
 
 		 426 aa  847    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  99.77 
 
 		 426 aa  846    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  52.81 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  54.03 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  54.03 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  53.06 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 442 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  53.55 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  51.42 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  54.57 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  55.64 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  53.92 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  53.58 
 
 		 458 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  53.06 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  52.81 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  54.21 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  51.6 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  51.36 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  54.9 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  53.58 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  53.58 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  55.93 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  48.83 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.59 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  52.84 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  48.94 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  52.24 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  52.84 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  52.84 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  53.33 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  53.56 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.35 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.35 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.35 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.35 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.35 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.35 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.35 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  52.93 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  48.4 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  51.11 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  48.41 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  49.16 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  49.63 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  51.36 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  52.88 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  46.96 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  50.49 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  48.15 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  48.69 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  50.38 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  48.8 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 422 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  48.65 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 435 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  50.37 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  46.93 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  46.93 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  46.19 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  46.65 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  45.93 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  39.44 
 
 		 423 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  39.21 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  39.44 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  39.44 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  39.44 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  39.21 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  38.98 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  38.98 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  41.29 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  40.52 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  40.09 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  40.09 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  39.67 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  40.28 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  39.67 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.86 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  39.21 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  40.09 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  40.05 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  40.09 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  39.63 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  36.81 
 
 		 437 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  39.81 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  39.43 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  39.81 
 
 		 438 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  39.18 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  38.48 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  37.24 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  39.1 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  39.1 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  36.17 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>