More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4991 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 466 aa  932    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 475 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  58.85 
 
 		 438 aa  461  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  40.28 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  41.11 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  41.71 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  41.71 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  42.65 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  41.32 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  41.49 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  43.52 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  42.82 
 
 		 423 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  40.87 
 
 		 422 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  43.52 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  43.03 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  42.79 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  38.53 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  44 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  42.58 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  42.54 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  42.54 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  38.86 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  43.73 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  42.79 
 
 		 424 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  41.49 
 
 		 434 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  42.54 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  40.77 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  40.77 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  41.59 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  40.77 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  40.77 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  40.77 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  41.38 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  42.93 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  39.85 
 
 		 423 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  39.85 
 
 		 423 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  39.85 
 
 		 423 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  39.85 
 
 		 423 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  40.68 
 
 		 415 aa  302  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  39.61 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  39.61 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  39.61 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  39.61 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  39.36 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  42.11 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  42.11 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  42.11 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 449 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 442 aa  298  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.86 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  42.51 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  38.54 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  39.29 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.2 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  40.97 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  40.53 
 
 		 439 aa  296  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.05 
 
 		 440 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.8 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.88 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.05 
 
 		 440 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.51 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.42 
 
 		 428 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.51 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.51 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.51 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.51 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  42.03 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  39.17 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  40.14 
 
 		 439 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  42.93 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  39.27 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  39.27 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  38.63 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  40.91 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.54 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.07 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  39.17 
 
 		 447 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  40.83 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3394  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  42.51 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
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NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  39.42 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.97 
 
 		 420 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
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