More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3205 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  90.78 
 
 		 435 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  90.78 
 
 		 435 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 435 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  90.78 
 
 		 472 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  90.78 
 
 		 435 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  91.45 
 
 		 432 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  91.72 
 
 		 434 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  90.93 
 
 		 470 aa  736    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  90.78 
 
 		 435 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  78.19 
 
 		 430 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  90.76 
 
 		 432 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  90.78 
 
 		 435 aa  723    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  90.78 
 
 		 435 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  99.08 
 
 		 434 aa  854    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  90.76 
 
 		 432 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  70.1 
 
 		 442 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  67.44 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  70.1 
 
 		 435 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  69.85 
 
 		 435 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  70.59 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  70.1 
 
 		 458 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  70.34 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  70.34 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  70.1 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  64.9 
 
 		 438 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  63.91 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  66.67 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  69.61 
 
 		 435 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  69.61 
 
 		 435 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  67.63 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  69.61 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  65.29 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  60.43 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  58.23 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  59.81 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  58.55 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  56.94 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  58.72 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  58.65 
 
 		 466 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  57.69 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  58.87 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  56.49 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  58.68 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  59.11 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  58.31 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  57.21 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  56.02 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  56.53 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  55.04 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  55.42 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  51.19 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  56.16 
 
 		 409 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  56.34 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  52.91 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  54.88 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  51.74 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  51.36 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  51.08 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  51.36 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  56.34 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  53.44 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  50.61 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  49.02 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  44.25 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  38.07 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  38.31 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  37.83 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  37.83 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  38.55 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  41.59 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  37.83 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  38.81 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  37.83 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  37.83 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  38.55 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  38.55 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  40.53 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 		 443 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  38.68 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  38.44 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  38.44 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  38.44 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  39.62 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  38.58 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  38.44 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  39.19 
 
 		 443 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  38.81 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  38.67 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  38.22 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  38.44 
 
 		 423 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  39.04 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  38.72 
 
 		 443 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  39.49 
 
 		 421 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  38.06 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>