More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4373 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 424 aa  827    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  62.5 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  47.21 
 
 		 435 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  44.79 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  46.88 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  44.53 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  45.82 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  44.47 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  43.87 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  47.53 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  47.89 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  45.95 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  43.14 
 
 		 442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  46.9 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  43.37 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  43.28 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  45.52 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  44.28 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  43.36 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  43.63 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  44.28 
 
 		 435 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  43.38 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  44.3 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  44.3 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  42.42 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  43.63 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  41.85 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 		 441 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  43.8 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  44.53 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  45.57 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  44.28 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  41.85 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  44.28 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  45.22 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  42.33 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  43.53 
 
 		 432 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.28 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  43.32 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  42.29 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  46.54 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  43.28 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  43.28 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  41.25 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  42.78 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.28 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.28 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.28 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.28 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.28 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.28 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.28 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  40.14 
 
 		 421 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  42.78 
 
 		 453 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  38.96 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  41.44 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  38.26 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  40.45 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  40.35 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  39.26 
 
 		 426 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  39.26 
 
 		 426 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3394  sodium:dicarboxylate symporter  34.84 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3410  sodium:dicarboxylate symporter  36.99 
 
 		 502 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3423  sodium:dicarboxylate symporter  36.99 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 		 475 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3675  sodium:dicarboxylate symporter  34.76 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  31.23 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  33.33 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  31.23 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  31.23 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  31.23 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  31.23 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  33.41 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  33.33 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  34.62 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  33.08 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  30.58 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.58 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.58 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  30.58 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  30.58 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  31.09 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  31.09 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  31.09 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  30.6 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  31.09 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  32.14 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  34.07 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  34.07 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  34.07 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  34.5 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0995  sodium:dicarboxylate symporter  31.81 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  30.94 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>