More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3423 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3423  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 495 aa  985    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3410  sodium:dicarboxylate symporter  91.12 
 
 		 502 aa  866    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3675  sodium:dicarboxylate symporter  82.77 
 
 		 467 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0995  sodium:dicarboxylate symporter  60.85 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3394  sodium:dicarboxylate symporter  58.6 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  48.16 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.82 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  47.32 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  48.77 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.24 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.53 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  47.44 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  48.77 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.02 
 
 		 428 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  48.58 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.58 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.76 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  48.19 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.76 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.88 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.34 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  48.33 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  49.04 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.56 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  47.27 
 
 		 437 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  47.7 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  48.07 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  48.19 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  46.76 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.92 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.85 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  47.42 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.3 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.53 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.64 
 
 		 430 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.53 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  47.8 
 
 		 448 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.53 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.34 
 
 		 451 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  45.14 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.77 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.28 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.93 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.28 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.4 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.06 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.04 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.61 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.99 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.22 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  44.26 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.19 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.88 
 
 		 420 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.61 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  43.2 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5393  sodium:dicarboxylate symporter  44.2 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  45.05 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3554  sodium:dicarboxylate symporter  46.56 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.57 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  50.12 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  43.64 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.08 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.57 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.55 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  44.93 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  46.59 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.58 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.61 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.39 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.32 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6387  sodium:dicarboxylate symporter  47.22 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.85 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  44.47 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  46.86 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  44.24 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.07 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.29 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.53 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.53 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3356  Sodium/dicarboxylate symporter  44.12 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  46.86 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2501  sodium:dicarboxylate symporter  44.44 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  45.89 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>