More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4413 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 468 aa  927    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  56.95 
 
 		 454 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8197  sodium:dicarboxylate symporter  63.95 
 
 		 450 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0441  sodium:dicarboxylate symporter  53.23 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.23 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  55.63 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  54.85 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.08 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.56 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  54.61 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  54.61 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  57.08 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  54.36 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.09 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.08 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.23 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  54.18 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.65 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.46 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  53.1 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.42 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.21 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  53.24 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.29 
 
 		 452 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.21 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.2 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  53.26 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.63 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.2 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  53.78 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  52.22 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.21 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  52.56 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.99 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  52.36 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  52.6 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  52.6 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.35 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.35 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.98 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  53.33 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.14 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.14 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.14 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.94 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  52.07 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.14 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  54.18 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.94 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.42 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.46 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.14 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.35 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  53.27 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.46 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.46 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.42 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  53.14 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.35 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  52.65 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.74 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  52.86 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.71 
 
 		 452 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.47 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.47 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  51.88 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.47 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.38 
 
 		 454 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  53.61 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.45 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  53.97 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  51.97 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.49 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  50.98 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  52.29 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.82 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.49 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.25 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  50.7 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.57 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.49 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.25 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  53.86 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.26 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.98 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.51 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.74 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.51 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.25 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.25 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.27 
 
 		 420 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.81 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.27 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  52.13 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.52 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>