More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2279 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Plasmid clonability

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2297  sodium:dicarboxylate symporter  83.6 
 
 
450 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372192  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  93.98 
 
 
465 aa  854    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  82.76 
 
 
457 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  82.83 
 
 
453 aa  713    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  93.98 
 
 
465 aa  856    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
462 aa  905    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.08 
 
 
428 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.81 
 
 
429 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.32 
 
 
429 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.32 
 
 
429 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.12 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  57.08 
 
 
437 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  59.32 
 
 
439 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.34 
 
 
443 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.29 
 
 
429 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  59.48 
 
 
434 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  57.74 
 
 
439 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.29 
 
 
429 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.05 
 
 
430 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 
447 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  61.07 
 
 
445 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.05 
 
 
430 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.39 
 
 
429 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.29 
 
 
429 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  59.63 
 
 
443 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.05 
 
 
430 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  56.08 
 
 
453 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  57.53 
 
 
454 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.64 
 
 
465 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.39 
 
 
444 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.64 
 
 
444 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  62.53 
 
 
445 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  62.17 
 
 
449 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2234  sodium:dicarboxylate symporter  62.29 
 
 
442 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.39 
 
 
428 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.39 
 
 
428 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  56.54 
 
 
444 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.15 
 
 
428 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.15 
 
 
428 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.31 
 
 
444 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.15 
 
 
428 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.15 
 
 
428 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  54.92 
 
 
449 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.42 
 
 
454 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  60.28 
 
 
445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  57 
 
 
447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  57.21 
 
 
425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  54.14 
 
 
447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  56.59 
 
 
442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  58.26 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.21 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.82 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1244  sodium:dicarboxylate symporter  60.92 
 
 
444 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  55.61 
 
 
440 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  55.27 
 
 
450 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.28 
 
 
426 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  55.61 
 
 
440 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  55.28 
 
 
440 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.71 
 
 
444 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  54.74 
 
 
449 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.71 
 
 
426 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  57.44 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  55.04 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.17 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.46 
 
 
440 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.94 
 
 
428 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  54.82 
 
 
446 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.99 
 
 
452 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.46 
 
 
440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.77 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09460  C4-dicarboxylate transport protein  57.35 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.81039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.15 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  55 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.21 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  55 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.09 
 
 
440 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  53.64 
 
 
460 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  54.99 
 
 
434 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  55.97 
 
 
455 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.62 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.14 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.95 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  54.12 
 
 
438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.14 
 
 
442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.24 
 
 
449 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2729  sodium:dicarboxylate symporter  56.83 
 
 
461 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4197  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.43 
 
 
426 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.12 
 
 
430 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.38 
 
 
447 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.99 
 
 
439 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
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NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  53.33 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  55.07 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.94 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.409819 
 
 
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