More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0441 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0441  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
493 aa  993    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  53.23 
 
 
468 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  53.19 
 
 
442 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.74 
 
 
465 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  52.1 
 
 
440 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.87 
 
 
449 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  50.82 
 
 
454 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  52.1 
 
 
440 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  49.77 
 
 
450 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  49.77 
 
 
450 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 
437 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.23 
 
 
447 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  52.34 
 
 
440 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.86 
 
 
452 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  50.11 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  49.44 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  49.42 
 
 
439 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.59 
 
 
454 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.24 
 
 
443 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.7 
 
 
450 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  49.04 
 
 
447 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.15 
 
 
448 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  48.48 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  48.36 
 
 
447 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 
445 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.76 
 
 
444 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.89 
 
 
442 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  48.21 
 
 
425 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  48.8 
 
 
455 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  48.56 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  48.94 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.33 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.93 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  48.56 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  47.94 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.12 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.89 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.9 
 
 
440 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.17 
 
 
430 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.68 
 
 
438 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.67 
 
 
420 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.93 
 
 
420 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.67 
 
 
420 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.55 
 
 
447 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.46 
 
 
420 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.96 
 
 
428 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.96 
 
 
428 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.76 
 
 
428 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.47 
 
 
429 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.96 
 
 
444 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  47.14 
 
 
446 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  49.09 
 
 
448 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.16 
 
 
444 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 
442 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  46.9 
 
 
445 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  46.82 
 
 
449 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.93 
 
 
452 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.4 
 
 
429 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0264  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.76 
 
 
449 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.608146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.47 
 
 
429 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.42 
 
 
451 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.16 
 
 
428 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
428 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  48.19 
 
 
447 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
428 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0294  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.74 
 
 
449 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 
445 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  48.42 
 
 
446 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.92 
 
 
428 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  46.43 
 
 
438 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  47.65 
 
 
447 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
428 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.04 
 
 
439 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.2 
 
 
413 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
428 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.8 
 
 
428 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.18 
 
 
426 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.8 
 
 
428 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.6 
 
 
429 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.7 
 
 
420 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.96 
 
 
444 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.84 
 
 
429 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.84 
 
 
429 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.6 
 
 
430 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.8 
 
 
428 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.8 
 
 
428 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.84 
 
 
429 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.6 
 
 
430 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.8 
 
 
428 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>