More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3554 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2501  sodium:dicarboxylate symporter  79.42 
 
 		 452 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6387  sodium:dicarboxylate symporter  86.46 
 
 		 456 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3554  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 455 aa  902    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3356  Sodium/dicarboxylate symporter  80.17 
 
 		 457 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5393  sodium:dicarboxylate symporter  97.8 
 
 		 455 aa  864    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2773  Sodium:dicarboxylate symporter  61.12 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  57.97 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  57.74 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4063  C4-dicarboxylate transport protein  58.39 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  57.74 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5153  sodium:dicarboxylate symporter  60.64 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  54.72 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  54.96 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.96 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0995  C4-dicarboxylate transport transmembrane protein  55.11 
 
 		 447 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.37068  normal  0.0301599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.96 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.96 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  54.72 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.96 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.96 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.72 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.4 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.01 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.61 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.93 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.7 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.86 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.7 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.93 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.93 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.93 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.93 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31210  C4-dicarboxylate transport protein  53.79 
 
 		 441 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.13 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  52.05 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  52.06 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.1 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  53.83 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.9 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.1 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.1 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.27 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  53.72 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2841  sodium:dicarboxylate symporter  57.35 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.4 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.62 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.27 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.77 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  54.57 
 
 		 447 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  50.82 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.29 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  54.48 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0462  sodium:dicarboxylate symporter  56.75 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  51.44 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  54.03 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.94 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  53.38 
 
 		 447 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  52.06 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  55.42 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  53.44 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.9 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.63 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.64 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.11 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3460  sodium:dicarboxylate symporter  52.44 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  54.37 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.16 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.48 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.48 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.08 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  53.23 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.68 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.68 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.68 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.48 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.24 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.77 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  52.83 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.56 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.19 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.36 
 
 		 413 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.76 
 
 		 444 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 420 aa  445  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.81 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.81 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.81 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.86 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.1 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.06 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.81 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.81 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.92 
 
 		 439 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>