More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4600 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  90.71 
 
 		 435 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  81.57 
 
 		 435 aa  698    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  93.2 
 
 		 442 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  90.5 
 
 		 458 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  92.97 
 
 		 442 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  90.71 
 
 		 435 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  97.06 
 
 		 442 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  92.15 
 
 		 435 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  92.97 
 
 		 442 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  90.71 
 
 		 435 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 442 aa  879    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  92.15 
 
 		 435 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  73.58 
 
 		 439 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  70.88 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  67.2 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  70.34 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  70.1 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  71.08 
 
 		 470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  71.57 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  71.57 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  71.57 
 
 		 472 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  71.57 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  71.57 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  71.57 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  71.57 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  71.08 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  71.08 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  70.83 
 
 		 432 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  66.58 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  57.92 
 
 		 438 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  62.11 
 
 		 426 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  59.4 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  57.11 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  57.78 
 
 		 437 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  57.81 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  55.25 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  51.52 
 
 		 490 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  52.9 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  54.63 
 
 		 435 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  52.12 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  55.56 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  54.94 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  54.89 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  55.5 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  56.14 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  50.8 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  54.63 
 
 		 419 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  52.81 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  52.81 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  54.93 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  53.79 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  55.37 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  53.43 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  50.62 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  51.97 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  52.64 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  53.81 
 
 		 425 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  53.11 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  58.08 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  51.01 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  48.71 
 
 		 442 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  48.11 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  47.61 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  47.13 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  43.72 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  44.53 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  40 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  39.76 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  39.76 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  39.76 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  39.76 
 
 		 423 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  39.76 
 
 		 423 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  39.52 
 
 		 423 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  39.52 
 
 		 423 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  38.35 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  38.2 
 
 		 440 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  38.2 
 
 		 440 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  38.2 
 
 		 440 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  35.98 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  38.55 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  36.91 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  40.83 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.47 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.89 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.79 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.65 
 
 		 443 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  39.21 
 
 		 414 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  38.3 
 
 		 421 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  38.53 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.2 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>