More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1270 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  80.88 
 
 		 412 aa  634    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 409 aa  817    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  58.31 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  57 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  54.52 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  56.16 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  54.28 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  54.55 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  56.4 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  57.6 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  54.77 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  55.45 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  56.48 
 
 		 430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  57.95 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  56.2 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  54.82 
 
 		 437 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  56.68 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  55.45 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  54.79 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  55.69 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  54.77 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  56.17 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  56.17 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  56.65 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  56.64 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  56.27 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  56.17 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  56.65 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  55.83 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  55.83 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  55.83 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  55.83 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  55.83 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  55.83 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  55.83 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  55.93 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  52.7 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  52.45 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  54.9 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  55.37 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  52.55 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  50.73 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  50.49 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  56.44 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  56.44 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  52.32 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  52.1 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  52.93 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  52.55 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  52.93 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  51.36 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  53.06 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  55.69 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  50.49 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  52.44 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  51.35 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  52.05 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  52.22 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  50.37 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  50.37 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  49.51 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  48.64 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  48.88 
 
 		 424 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  40.19 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  40.19 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  40.19 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  40.19 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  40.19 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  39.95 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  39.95 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  39.95 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  41.67 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  41.52 
 
 		 443 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  39.55 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  40.55 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  40.2 
 
 		 466 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  40.49 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  41.03 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  41.03 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  41.28 
 
 		 438 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  40.29 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  42.32 
 
 		 438 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  40.29 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  40.7 
 
 		 437 aa  292  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  39.4 
 
 		 444 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  39.4 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  39.56 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  39.56 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  40.91 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  39.66 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>