More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4649 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 437 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  57.83 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  57.92 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  58.23 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.7 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  58.55 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  57.78 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.7 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  60.7 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.7 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  60.7 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  60.7 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  60.7 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.7 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  60.82 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  60.25 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  60.25 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  55.56 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  58.44 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  60.38 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  56.98 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  54.35 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  56.05 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  60.05 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  59.75 
 
 		 432 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  56.28 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  53.35 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  58.27 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  51.51 
 
 		 438 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  58.81 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  51.87 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  58.81 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  59.84 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  51.89 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  53.96 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  55.81 
 
 		 412 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  55.14 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  58.75 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  52.66 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  54.86 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  52.97 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  53.27 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  54.82 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  53.73 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  52.49 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  51.11 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  52.23 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  53.92 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  52.49 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  49.74 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  52.49 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  52.62 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  49.25 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  48.83 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  48.83 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  50.84 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  52.57 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  49.52 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  48.89 
 
 		 415 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  43.95 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  41.67 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  38.65 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.9 
 
 		 423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.9 
 
 		 423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  37.14 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.9 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  36.9 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  36.9 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  39.26 
 
 		 454 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  36.67 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  36.67 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  36.67 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  38.86 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  40.1 
 
 		 423 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.85 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  37.65 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.36 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  35.36 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.11 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  39.36 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.11 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  37.65 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.11 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  37.99 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  38.12 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  38.86 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  36.75 
 
 		 437 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.08 
 
 		 420 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  36.61 
 
 		 422 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  36.96 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  37.37 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.34 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 421 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  37.68 
 
 		 438 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>