More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2374 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  74.49 
 
 		 436 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  77.43 
 
 		 435 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  94.7 
 
 		 427 aa  795    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 434 aa  866    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  75.43 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  76.1 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  64.52 
 
 		 428 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  63.72 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  64.49 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  55.94 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  55.48 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  54.78 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.7 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  55.45 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  53.99 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  55.22 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.38 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.38 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  57.38 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.38 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  57.38 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  57.38 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  57.38 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  53.04 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  52.36 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  52 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  53.38 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  57.38 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  53.88 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  57.7 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  57.7 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  51.59 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  51.36 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  53.32 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  54.48 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  55.75 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  54.01 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  54.01 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  52.49 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  53.07 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  53.44 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  52.24 
 
 		 439 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  53.68 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  52.82 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  49.65 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  52.11 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  50.64 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  54.52 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  52.24 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  50.36 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  54.52 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  53.04 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  49.45 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  48.85 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  54.52 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  52.44 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  49.88 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  49.88 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  44.77 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  43.84 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  45.02 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  43.38 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 423 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  39.57 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  39.06 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  39.57 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  39.34 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  39.06 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  39.06 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  39.34 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  39.34 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  38.39 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  40.94 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  37.93 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  37.76 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  38.66 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  37.76 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  38.66 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  36.59 
 
 		 443 aa  272  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  37.09 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  38.43 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  38.37 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  37.2 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  38.37 
 
 		 424 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  37.2 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  37.96 
 
 		 423 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>