More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1652 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 453 aa  904    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  56.46 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  55.41 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  59.84 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  56.01 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  54.61 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  52.2 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  53.39 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  54.38 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  53.1 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  52.12 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  52.56 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  52.78 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  52.34 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  51.19 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.07 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  51.52 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  54.04 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  56.01 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  54.13 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  52.34 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  54.13 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  53.67 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  53.05 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  53.85 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  53.85 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  53.35 
 
 		 458 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  53.85 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  51.81 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  55.45 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  53.85 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  53.71 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  51.58 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  51.44 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  53.62 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  53.62 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  51.12 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  49.89 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  55.62 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  52.49 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  52.71 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  52.71 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  56.35 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  50.88 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  53.85 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  58.62 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  53.24 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  58.09 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  55.67 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  55.93 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  50.44 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  58.06 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  49.89 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  50.34 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  49.66 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  55.8 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  56.87 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  47.4 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  47.49 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  46.92 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  46.92 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  45.78 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  43.16 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  43.92 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  41.88 
 
 		 423 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  41.88 
 
 		 423 aa  306  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  41.88 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  41.88 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  41.88 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  41.88 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  41.91 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  41.62 
 
 		 423 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  41.62 
 
 		 423 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  41.5 
 
 		 423 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  43.29 
 
 		 423 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  41.95 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  42.68 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  43.31 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  42.42 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.04 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  43.31 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  42.17 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  42.17 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  43.04 
 
 		 423 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  42.25 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  43.28 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  42.32 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  43.01 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.61 
 
 		 421 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  42.74 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  41.94 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  40.21 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.29 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.18 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  41.49 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>