More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0742 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  97.15 
 
 		 421 aa  769    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  100 
 
 		 421 aa  821    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  68.97 
 
 		 422 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  71.6 
 
 		 423 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  71.6 
 
 		 423 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  71.6 
 
 		 423 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  71.84 
 
 		 424 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  71.36 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  71.12 
 
 		 423 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  71.12 
 
 		 423 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  70.81 
 
 		 423 aa  594  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  71.6 
 
 		 424 aa  597  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  71.12 
 
 		 423 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  70.55 
 
 		 421 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  64.68 
 
 		 423 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  64.44 
 
 		 423 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  64.44 
 
 		 423 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  64.2 
 
 		 423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  64.44 
 
 		 423 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  64.44 
 
 		 423 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  64.44 
 
 		 423 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  64.2 
 
 		 423 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  64.2 
 
 		 423 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  67.22 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  61.32 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  60.38 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  60.47 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  60.24 
 
 		 444 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  61.08 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  59.95 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  56.78 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  57.68 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  57.68 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  57.92 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  57.92 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  57.92 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  56.84 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  57.92 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  57.92 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  57.68 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  57.01 
 
 		 438 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  57.01 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  60.19 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  58.16 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  58.16 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  59.95 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  59.72 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  58.16 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  58.06 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  60.2 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  57.01 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  53.98 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  52.12 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  52.12 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  52.12 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  51.65 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  55.24 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  55.24 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  49.51 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.43 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.19 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.19 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.95 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.95 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.19 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.19 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.87 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.95 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.85 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.95 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  44.76 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  45.54 
 
 		 439 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  47.68 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  42.31 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  42.31 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  42.31 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.31 
 
 		 447 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1341  proton/glutamate symporter protein, C-terminus  73.08 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000340093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.89 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  41.22 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  44.93 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.24 
 
 		 443 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  44.73 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.07 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  43.69 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.17 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  43.73 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.56 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.23 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.6 
 
 		 431 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.57 
 
 		 436 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 449 aa  342  9e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  42.96 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>