More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2242 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 419 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  55.29 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  53.24 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  53 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  53 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  53.43 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  50.37 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  50.12 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  48.9 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  49.02 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  48.9 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  49.15 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  49.15 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  48.9 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  49.14 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  49.15 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  49.15 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  48.9 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  48.9 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  49.15 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  49.27 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  49.39 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  49.88 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  50.12 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  49.88 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  49.63 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  48.89 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  48.89 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  49.14 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  48.65 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  47.69 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  45.34 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  47.45 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  47.69 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  47.45 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  47.79 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  47.2 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  47.69 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  47.69 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  47.2 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  47.93 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  45.72 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  45.72 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  45.72 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  45.59 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  48.17 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  45.48 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  45.48 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  45.48 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  45.23 
 
 		 423 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  45.23 
 
 		 423 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  48.18 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  47.68 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  40.54 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  40.82 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.78 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  43.8 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  43.8 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.42 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  41.01 
 
 		 439 aa  295  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.77 
 
 		 448 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  39.71 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  38.76 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0995  sodium:dicarboxylate symporter  40.72 
 
 		 465 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  39.33 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  38.98 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  41.69 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.4 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  38.98 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  37.86 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  38.31 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.36 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.9 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.87 
 
 		 452 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3394  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.75 
 
 		 449 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  36.5 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.47 
 
 		 447 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.37 
 
 		 465 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  39.75 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.47 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.23 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  36.72 
 
 		 420 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.65 
 
 		 429 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>