More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1122 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  78.19 
 
 		 435 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  78.78 
 
 		 434 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  78.92 
 
 		 470 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 430 aa  855    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  77.03 
 
 		 434 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  78.54 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  78.54 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  78.54 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  78.54 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  78.54 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  78.54 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  78.54 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  79.27 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  79.66 
 
 		 432 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  79.66 
 
 		 432 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  70.88 
 
 		 442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  70.56 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  70.79 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  69.53 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  71.36 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  71.12 
 
 		 442 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  71.36 
 
 		 442 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  71.36 
 
 		 442 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  71.81 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  73.04 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  73.04 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  70.27 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  73.04 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  63.93 
 
 		 438 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  70.12 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  67.57 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  65.32 
 
 		 439 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  59.43 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  57.21 
 
 		 490 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  57.82 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  56.41 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  61.2 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  57.39 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  58.09 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  56.64 
 
 		 466 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  57.88 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  56.84 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  53.1 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  57.95 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  58.52 
 
 		 433 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  57.14 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  57.42 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  55.63 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  56.64 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  55.76 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  54.9 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  55.39 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  56.48 
 
 		 409 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  54.21 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  54.21 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  51.57 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  53.99 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  51.75 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  57.94 
 
 		 417 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  52.22 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  51.75 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  52.71 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  47.96 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  46.55 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  45 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 422 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  36.92 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.68 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.68 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.68 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  36.68 
 
 		 423 aa  292  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  36.68 
 
 		 423 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  36.45 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  36.45 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.21 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  41.73 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  36.87 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 		 424 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.95 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  40.25 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.95 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.95 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.95 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  40.25 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  39.46 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  40.25 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  40.25 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  37.64 
 
 		 438 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  39.31 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  38.1 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.08 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.36 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  38.85 
 
 		 437 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  37.64 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  38.82 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.09 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>