More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1622 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 475 aa  957    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  54.38 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  41.57 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.94 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  40.86 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  39.91 
 
 		 443 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.62 
 
 		 444 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  40.86 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.73 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  41.09 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  41.98 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  42.72 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  42.72 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  40.86 
 
 		 443 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  40.8 
 
 		 442 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  40.8 
 
 		 442 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  42.72 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  40.57 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  40.86 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  42.72 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  42.48 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  42.48 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  42.24 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  40.81 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  40.81 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  40.81 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  40.81 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  40.77 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  40.81 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  42.24 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  40.81 
 
 		 423 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  40.57 
 
 		 423 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  40.33 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  40.57 
 
 		 423 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  41.13 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  39.81 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  41.13 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 437 aa  302  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.92 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  40.76 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  41.83 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  41.29 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  42.89 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  42.16 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.57 
 
 		 447 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  41.46 
 
 		 448 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  40 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  39.1 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  42.48 
 
 		 421 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  40 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  40 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  41.04 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.34 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  39 
 
 		 414 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  39.71 
 
 		 447 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  43.43 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.04 
 
 		 413 aa  291  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  39.23 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.63 
 
 		 420 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  41.27 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  36.74 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.89 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  37.29 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  37.29 
 
 		 440 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  39.47 
 
 		 447 aa  289  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  39.04 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  40.79 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.8 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  40.79 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  41.04 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.8 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.65 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.41 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.8 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.65 
 
 		 440 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.8 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.8 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  38.74 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  39.28 
 
 		 439 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  37.8 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  38.74 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.52 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.56 
 
 		 420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.68 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
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NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.52 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
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