More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3545 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 433 aa  856    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  62.56 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  47.33 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  46.88 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  44.75 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  47.88 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  49.4 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  45.5 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  46.59 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  46.24 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  43.72 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  45.32 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  44.84 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 		 435 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 442 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 442 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  44.6 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  44.36 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  44.92 
 
 		 442 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  48.76 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  44.78 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  43.36 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  47.26 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  45.59 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  46.63 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  46.84 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  44.24 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  44.1 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  44.47 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  46.15 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  45.04 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  42.99 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  44.79 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  45.24 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  42.59 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  43.93 
 
 		 405 aa  322  9.000000000000001e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.87 
 
 		 470 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  46.09 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  41.39 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  45.57 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  42.93 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  45.32 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  45.32 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  45.32 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  40.98 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.63 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.63 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.63 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.63 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.63 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.63 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  43.63 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.81 
 
 		 421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  45.43 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  44.02 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  41.29 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  41.29 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  41.67 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  42 
 
 		 412 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  41.58 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  31.71 
 
 		 475 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  33.95 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  34.73 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  36.72 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  33.02 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  34.54 
 
 		 438 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3546  sodium:dicarboxylate symporter  37 
 
 		 509 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  32.03 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  32.03 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  32.03 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  32.03 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  32.03 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  36.66 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  36.64 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3410  sodium:dicarboxylate symporter  34.01 
 
 		 502 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  36.43 
 
 		 443 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  34.05 
 
 		 438 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  32.49 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  32.49 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  32.49 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  32.49 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  32.24 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  32.49 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  32.24 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  32.24 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  32.24 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  36.54 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3394  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3675  sodium:dicarboxylate symporter  34.33 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3423  sodium:dicarboxylate symporter  35.07 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  32.75 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  33.81 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  34.28 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>