More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01901 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01901  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.836498  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1733  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  45 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0810  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4335  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4064  two component LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.368666  normal  0.0789055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  39.34 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5257  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  40.32 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3436  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.15 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  39.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  45 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  35 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.23 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  43.33 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  35 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 497 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 140 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01879  response regulator  30.56 
 
 		 169 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000614586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.97 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  41.07 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  43.66 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01869  hypothetical protein  30.56 
 
 		 191 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000330184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  43.86 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>