111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1098 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1098  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
129 aa  255  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0365125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  45.16 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  39.13 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  43.02 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  37.36 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  39.06 
 
 
172 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  34.92 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  41.56 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  41.56 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  41.86 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  35.05 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  36.78 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  34.34 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  33.77 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  29.82 
 
 
324 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  38.96 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  29.82 
 
 
324 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  29.82 
 
 
324 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  35.9 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  30 
 
 
323 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  37.66 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  33.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  40.26 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  40.26 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  40.26 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  44.07 
 
 
142 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  38.57 
 
 
131 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  31.78 
 
 
138 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  31.78 
 
 
138 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  35.37 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0352  PTS system fructose subfamily IIA component  36.36 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  34.85 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  46.15 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  43.33 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.13 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  37.65 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  35.06 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  29.36 
 
 
320 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  35.06 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0721  PTS system fructose subfamily IIA component  38.71 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  30.93 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  35.9 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  34.57 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  34.57 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  35.48 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  38.27 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  34.23 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.63 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0745  PTS system fructose subfamily IIA component  31.96 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  31.06 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  37.21 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.93 
 
 
318 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  30 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  29.9 
 
 
322 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  29.9 
 
 
322 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.9 
 
 
322 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.9 
 
 
322 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  29.9 
 
 
322 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  34.33 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2798  PTS system fructose subfamily IIA component  38.71 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  31.17 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  35.44 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  37.61 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  37.21 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  28.57 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0323  PTS system, unknown pentitol phosphotransferase enzyme II component, putative  29.6 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119677  normal  0.019889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  31.18 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0469  PTS system fructose subfamily IIA component  31.65 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  31.18 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.19 
 
 
313 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  35.06 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  41.86 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  41.86 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  28.57 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.61 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  50 
 
 
135 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  36.05 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  29.51 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0601  PTS system fructose subfamily IIA component  34.92 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2917  PTS system fructose subfamily IIA component  27.93 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0237  PTS system fructose subfamily IIA component  36.51 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697863  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0407  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2779  PTS system fructose subfamily IIA component  27.93 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4898  PTS system fructose subfamily IIA component  33.85 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>