More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1002 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1002  ABC transporter related protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  74.23 
 
 		 366 aa  301  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  73.71 
 
 		 360 aa  301  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  73.71 
 
 		 370 aa  299  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  73.2 
 
 		 371 aa  299  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  73.2 
 
 		 363 aa  298  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  72.68 
 
 		 376 aa  298  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  73.71 
 
 		 364 aa  298  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  72.68 
 
 		 374 aa  296  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  71.65 
 
 		 375 aa  294  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  72.16 
 
 		 370 aa  293  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  72.68 
 
 		 364 aa  293  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  70.1 
 
 		 375 aa  293  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  72.16 
 
 		 359 aa  293  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  73.71 
 
 		 370 aa  291  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  73.33 
 
 		 364 aa  292  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  72.68 
 
 		 356 aa  291  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  69.59 
 
 		 375 aa  291  7e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  70.62 
 
 		 358 aa  290  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  73.85 
 
 		 378 aa  290  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  70.62 
 
 		 361 aa  289  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  72.16 
 
 		 365 aa  286  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  70.26 
 
 		 366 aa  285  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  69.59 
 
 		 361 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  69.59 
 
 		 361 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  69.59 
 
 		 361 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  70.1 
 
 		 363 aa  281  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  70.1 
 
 		 363 aa  280  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  69.59 
 
 		 357 aa  276  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.07 
 
 		 379 aa  276  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  68.56 
 
 		 360 aa  274  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  66.49 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  67.53 
 
 		 360 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  64.43 
 
 		 370 aa  263  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  63.4 
 
 		 384 aa  262  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  67.01 
 
 		 355 aa  262  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  66.49 
 
 		 404 aa  261  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  64.43 
 
 		 426 aa  261  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  64.95 
 
 		 357 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  64.95 
 
 		 357 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  63.92 
 
 		 370 aa  258  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  65.46 
 
 		 410 aa  258  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  63.4 
 
 		 374 aa  257  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  64.95 
 
 		 406 aa  257  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  61.86 
 
 		 369 aa  257  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  61.86 
 
 		 369 aa  257  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  62.37 
 
 		 372 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  62.37 
 
 		 370 aa  255  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  64.43 
 
 		 380 aa  254  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.46 
 
 		 366 aa  254  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  63.92 
 
 		 368 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  62.89 
 
 		 393 aa  253  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  63.92 
 
 		 366 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  61.34 
 
 		 370 aa  251  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  65.46 
 
 		 355 aa  252  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  64.25 
 
 		 416 aa  251  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  65.46 
 
 		 368 aa  251  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 366 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 366 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 366 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 366 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 366 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  63.4 
 
 		 405 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  63.4 
 
 		 405 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  63.4 
 
 		 405 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  62.37 
 
 		 381 aa  251  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  61.34 
 
 		 370 aa  250  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  64.95 
 
 		 352 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  63.4 
 
 		 366 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.31 
 
 		 366 aa  249  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.31 
 
 		 366 aa  249  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  65.46 
 
 		 353 aa  249  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  65.98 
 
 		 353 aa  249  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  61.86 
 
 		 349 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.31 
 
 		 366 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.31 
 
 		 366 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  63.92 
 
 		 405 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  63.92 
 
 		 404 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  63.4 
 
 		 406 aa  249  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  63.92 
 
 		 398 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  62.37 
 
 		 364 aa  248  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  60.31 
 
 		 366 aa  248  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  64.95 
 
 		 354 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  64.95 
 
 		 355 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  61.86 
 
 		 357 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  61.86 
 
 		 357 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.31 
 
 		 377 aa  248  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  63.4 
 
 		 393 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  62.89 
 
 		 389 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  60.31 
 
 		 366 aa  248  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  61.86 
 
 		 349 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  64.95 
 
 		 354 aa  247  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  62.89 
 
 		 364 aa  247  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  61.34 
 
 		 367 aa  247  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  61.34 
 
 		 367 aa  247  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 371 aa  247  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  62.89 
 
 		 399 aa  247  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  59.28 
 
 		 378 aa  247  9e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  63.92 
 
 		 368 aa  247  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 393 aa  247  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>