79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2926 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 99 aa  190  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.57 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  39.8 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.3 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.82 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.78 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.31 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.26 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.51 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  45.31 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.81 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.29 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.34 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.14 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  41.27 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.66 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.55 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  41.94 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.58 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  40.3 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  40 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.26 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.76 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2972  anti-sigma28 factor FlgM  48.98 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.37231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.78 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.94 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  48.78 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  30.77 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  30.77 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23980  Anti-sigma-28 factor  62.16 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  30.77 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.49 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2200  anti-sigma28 factor FlgM  45.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  31.25 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2016  anti-sigma28 factor FlgM  45.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1240  anti-sigma28 factor FlgM  45.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1284  anti-sigma28 factor FlgM  45.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.281366  normal  0.146528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1269  anti-sigma28 factor FlgM  45.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0199272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  25.74 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  35.37 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  30.43 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  36.92 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.67 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.77 
 
 		 100 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  37.74 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  32 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1450  anti-sigma28 factor FlgM  40.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01067  anti-sigma factor for FliA (sigma 28)  40.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.43 
 
 		 97 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01075  hypothetical protein  40.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2575  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1194  anti-sigma28 factor FlgM  40.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2058  anti-sigma28 factor FlgM  40.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2529  anti-sigma28 factor FlgM  40.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.491687  normal  0.0344383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1194  anti-sigma28 factor FlgM  40.38 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  34.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  42.5 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.62 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2255  anti-sigma28 factor FlgM  45.95 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3732  anti-sigma-28 factor FlgM  43.59 
 
 		 126 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>