42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1541 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 104 aa  209  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  36 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  45.16 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40.35 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.24 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.9 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.82 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.48 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.22 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.04 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.96 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.8 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.07 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  31.91 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.21 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  43.75 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.21 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  30.85 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  34.29 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.21 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  34.29 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  29 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.95 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.72 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  56.25 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  26.83 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.72 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  36.54 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.72 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.25 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.25 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.72 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.72 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.25 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.08 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  33.78 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2418  anti-sigma-28 factor, FlgM  26.97 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.79 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  32.08 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.18 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  50 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>