48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1459 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  96.15 
 
 		 104 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  82.69 
 
 		 103 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  62.04 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  61.54 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  60.58 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.66 
 
 		 111 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  52.78 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  53.7 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.89 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.89 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.89 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.89 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.1 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.19 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.05 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.43 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  38.03 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.46 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.59 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.62 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  29.7 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.54 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.54 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.54 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.54 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  47.17 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.68 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.77 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.26 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  35.09 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  35.09 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  35.79 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.21 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.96 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.68 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  31.94 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2906  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  30 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  38 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  30.51 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  30.51 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>