30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2185 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  100 
 
 		 102 aa  203  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  51 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3121  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0767  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.16 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0784  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.58 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.5 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1677  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.64 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  32 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.2 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.99 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0498  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.51 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000267132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3095  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.76 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0190  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  44.44 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.79 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.79 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.11 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.79 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2005  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.06 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0663  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  30.11 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17160  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  37.74 
 
 		 88 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0092  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  33.96 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4101  hypothetical protein  35.48 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.56 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3217  anti-sigma-28 factor, FlgM  33 
 
 		 95 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.98 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>