16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3095 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3095  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  37.5 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.62 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0449  hypothetical protein  35 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0190  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.79 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.39 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  36.76 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1653  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  29.21 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1677  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.33 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  32 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.35 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0498  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.82 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000267132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0092  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  27.55 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.68 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0395  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.08 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>