26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2585 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 
103 aa  203  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2418  anti-sigma-28 factor, FlgM  65.09 
 
 
104 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  51.96 
 
 
101 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2005  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.71 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2373  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  31.07 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1677  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.99 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.99 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  38.81 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  38.2 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.49 
 
 
90 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.41 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.27 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.16 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3230  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.08 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.35 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  29 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0784  anti-sigma-28 factor, FlgM  64.52 
 
 
99 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0767  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.5 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  37.33 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000201318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3121  hypothetical protein  42.59 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0092  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  37.93 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  32.22 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17160  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  33.96 
 
 
88 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.39 
 
 
101 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3095  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.35 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  27.96 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>