24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2246 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0092  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  43.16 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1677  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.36 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.96 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  40.58 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.66 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0674  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0663  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  33.9 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0190  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.15 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3121  hypothetical protein  43.86 
 
 		 105 aa  47.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.99 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17160  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  38.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.4 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.98 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.38 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3095  anti-sigma-28 factor, FlgM  32 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.82 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3033  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.63 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2373  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  38.98 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  36.11 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0201  hypothetical protein  38.64 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.394821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2005  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.21 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.47 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  38.6 
 
 		 109 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>