14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2005 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2005  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 107 aa  216  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.71 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2418  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.85 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.95 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0663  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  43.28 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  34.69 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.21 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  35.23 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  36.84 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.23 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.98 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 101 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>