25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0674 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0674  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 
97 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  46.15 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.3 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1677  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.86 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2238  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0348656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  48.15 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.18 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.5 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  43.4 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  32.81 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0092  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  29.9 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3757  negative regulator of flagellin synthesis  38.46 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3841  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  38.46 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  31.25 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  35.19 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.07 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.41 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  36.76 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  35.71 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  36.23 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0663  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  33.33 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.1 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  25.64 
 
 
108 aa  40  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>