26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0939 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  213  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  97.17 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  45.76 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.87 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.35 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  36 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.29 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  37.93 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  46.43 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.81 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.43 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.43 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.91 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.8 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.91 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.09 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  39.22 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.09 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0674  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.81 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.25 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3841  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  32.76 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.48 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3757  negative regulator of flagellin synthesis  31.03 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.96 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>