49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1952 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 
100 aa  198  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  39.39 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.85 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.57 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  37 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.19 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.71 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2937  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.19 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.345651  normal  0.266234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.62 
 
 
109 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.62 
 
 
108 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.67 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.62 
 
 
109 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.33 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.18 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  42.37 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3072  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.19 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  40.68 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  32.91 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  43.33 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.94 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  37.88 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.38 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.85 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  31.65 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  36.62 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  36.62 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  36.62 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.23 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3712  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.69 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  34.85 
 
 
94 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3732  anti-sigma-28 factor FlgM  32.32 
 
 
126 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.99 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.51 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.91 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.91 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  37.14 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.38 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  46 
 
 
107 aa  40  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  38.33 
 
 
107 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>