29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1658 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.65 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.73 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  37 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.62 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  32.5 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4418  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.1 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  30 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  30 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.69 
 
 		 108 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.78 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  33.82 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  31.86 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.43 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  31.86 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.88 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  30.91 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.21 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.91 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3712  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.5 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  33.85 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  33.85 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  52.78 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.82 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  55.56 
 
 		 107 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  55.56 
 
 		 107 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  47.22 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>