25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4418 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4418  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 113 aa  221  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  52.29 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.29 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.29 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3712  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.06 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0571  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.45 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  48.33 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  51.22 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.13 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2972  anti-sigma28 factor FlgM  38.16 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.37231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.9 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  38.71 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.67 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.67 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  30.93 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.55 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  33.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  33.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  33.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.62 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1653  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  31.82 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.14 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>