33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3098 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 107 aa  204  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 107 aa  204  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  53.27 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4418  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.46 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3712  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.77 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  49.09 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0571  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  53.97 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.37 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.84 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.74 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.38 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  37.5 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.62 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.62 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.35 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.54 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.73 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2937  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.35 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.345651  normal  0.266234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.87 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3072  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.35 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  43.4 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  41.82 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  45 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.69 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>