18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3712 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3712  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  44.86 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.79 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.79 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4418  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.14 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.54 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  60.53 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0571  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  53.23 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  34.44 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.38 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.5 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.77 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.06 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.21 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>