24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2736 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  53.33 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  39.05 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  37.25 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3712  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.54 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.37 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.37 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4418  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.86 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.02 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  47.37 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3732  anti-sigma-28 factor FlgM  38.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.29 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  35.71 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  31.52 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.54 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3033  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.18 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  35.9 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  35.9 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.78 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.91 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.91 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  50 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>