57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5623 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3732  anti-sigma-28 factor FlgM  62.14 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.32 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.09 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  50 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  51.67 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.71 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  51.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23980  Anti-sigma-28 factor  37.5 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  53.66 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  53.85 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.78 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  43.55 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  53.33 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  43.55 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  43.55 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.45 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  41.94 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  51.28 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.57 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2937  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  43.55 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.345651  normal  0.266234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.95 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  37.04 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.04 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.37 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3072  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  45.16 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  44 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  55.26 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.46 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  36.25 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  53.66 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.63 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.63 
 
 		 104 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.44 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  41.3 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2972  anti-sigma28 factor FlgM  50 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.37231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.58 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.74 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4201  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.72 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  38.46 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>