56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1066 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  56.9 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.35 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.55 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  46.55 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.48 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.82 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.79 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.58 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.72 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  32.71 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.62 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.43 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  37.5 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.24 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  34.02 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.19 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000742  LfgM  54.29 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04907  hypothetical protein  60 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.13 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  28.43 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.93 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.96 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  41.38 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  24.75 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.81 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.84 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.93 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  42.59 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.43 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.65 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.63 
 
 		 102 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.96 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  30 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.92 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  30 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4412  anti-sigma-28 factor, FlgM family protein  42.55 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  33.96 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  33.96 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.81 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.91 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.05 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.38 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.93 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.18 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>