27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3104 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  65.42 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  48.48 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.88 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.16 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.78 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  45.71 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.72 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.27 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  34.65 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  34.65 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.05 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.05 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.05 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.05 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.57 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  43.55 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.5 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.85 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  32.04 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3033  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.04 
 
 		 87 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.92 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.06 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>