33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02934 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  100 
 
 		 109 aa  213  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  65.42 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  53.49 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.02 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.75 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.84 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2585  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.27 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  48.39 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  42.65 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  42.65 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  35 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.18 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.98 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  45 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  30.99 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  50 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.98 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.98 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.98 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.98 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.18 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  29.25 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.05 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.05 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.55 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.32 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  30.88 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  30.88 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  30 
 
 		 106 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2342  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, anti-sigma28 factor  43.55 
 
 		 103 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.6 
 
 		 97 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>