39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1472 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  100 
 
 		 102 aa  196  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.55 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.27 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  46.6 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  60.66 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.93 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  56.67 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.63 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.63 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.63 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.63 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.6 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.6 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  60 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.6 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.66 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.27 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.58 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.35 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  29.59 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  30.39 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  29.59 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  30.39 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.3 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.72 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  25.93 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.7 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.7 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.09 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.26 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  24.75 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  26 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  23.71 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.74 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  26.67 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.76 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  24.04 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>