54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3736 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 103 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  82.69 
 
 		 104 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  82.69 
 
 		 104 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  81.73 
 
 		 104 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  65.74 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.56 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  59.26 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  59.26 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  57.41 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  56.73 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  37 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.03 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  33.98 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  43.33 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.35 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  39.24 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.92 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  44.44 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.92 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.26 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.05 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.45 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.63 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.89 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.73 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.94 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.26 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.8 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.82 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.96 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  26 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.18 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2906  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  44 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.89 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  29.41 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  29.41 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  41.79 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.9 
 
 		 99 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1668  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  41.43 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0221857  normal  0.0203349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0037  putative FlgM, negative regulator of flagellin synthesis  41.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  28.92 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  60 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>