57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2854 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 111 aa  223  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  61.06 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  61.26 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  59.46 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.56 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.66 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.66 
 
 		 104 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.66 
 
 		 104 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  55.86 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  53.15 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.07 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.04 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.45 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  38.18 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.43 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  32.73 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.58 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.03 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.64 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  25.93 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.22 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  45.28 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  30.43 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  40 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0436  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.44 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  33.9 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  29.49 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  29.81 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.73 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.73 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  32.2 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.73 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3757  negative regulator of flagellin synthesis  34.52 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.55 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  38 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.82 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  35.09 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.34 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.92 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.23 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1668  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  44.64 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0221857  normal  0.0203349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3841  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.68 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0037  putative FlgM, negative regulator of flagellin synthesis  44.64 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.62 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.51 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.94 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2906  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.81 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.33 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>