24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0524 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  49.52 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.62 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.65 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  35 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  38.16 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.96 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.84 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  34.21 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.04 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  42 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.62 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  26.6 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.58 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.76 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40.38 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.42 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  39.62 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  38 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  37.31 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  38 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.03 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  35.42 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.93 
 
 		 105 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>