29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0889 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.02 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.96 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.63 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.14 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.71 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.59 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.59 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.04 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.78 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  34.18 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.71 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  38 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.82 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.58 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  32.91 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  40.43 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.65 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.21 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.56 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  31.48 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.23 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.68 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.85 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2418  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.415522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>