29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1478 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 101 aa  199  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  40.59 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  42.86 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.73 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.73 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  32.58 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.68 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.68 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.61 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  28 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.57 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.38 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.92 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.43 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.25 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  56.25 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.73 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  23.68 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  23.68 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  31.71 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  30.14 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.98 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.12 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>