59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1593 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 109 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  72.32 
 
 		 111 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  55.05 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  53.7 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  52.78 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  56.48 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  59.81 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  53.21 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  62.24 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.41 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  43.27 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.42 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.38 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  42.05 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  39.56 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  40.91 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  35.92 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.07 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  33.96 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.83 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  40 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  50.79 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  35.19 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.19 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.19 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.62 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.96 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  31.87 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  31.87 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  34.07 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  31.15 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2342  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, anti-sigma28 factor  47.62 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0674  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.5 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  38.98 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  30.56 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  30.56 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.82 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.37 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  26.6 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.95 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  42 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  29.35 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.77 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1478  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.98 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3841  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  26.97 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326583 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0326  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.12 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2217  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  27.78 
 
 		 105 aa  40  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.39 
 
 		 97 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>